title: Analysis of composition and variability of gut microbiota in closely related species of intertidal snails of the genus Littorina
metadata.name: dc.contributor.advisor
metadata.value: Потехин Алексей Анатольевич
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.contributor.advisor
metadata.value: Potehin Aleksej Anatolevic
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.contributor.author
metadata.value: Гафарова Елизавета Рустамовна
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.contributor.author
metadata.value: Gafarova Elizaveta Rustamovna
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.contributor.editor
metadata.value: Мальцева Арина Леонидовна
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.contributor.editor
metadata.value: Malceva Arina Leonidovna
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.date.accessioned
metadata.value: 2021-03-24T15:08:27Z
metadata.lang: -
metadata.name: dc.date.available
metadata.value: 2021-03-24T15:08:27Z
metadata.lang: -
metadata.name: dc.date.issued
metadata.value: 2019
metadata.name: dc.identifier.other
metadata.value: 047483
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.identifier.uri
metadata.value: http://hdl.handle.net/11701/25884
metadata.lang: -
metadata.name: dc.description.abstract
metadata.value: Моллюски рода Littorina представляют информативную модель для эволюционных исследований, поскольку включают несколько недавно дивергировавших видов и экотипов. Они достаточно детально изучены с точки зрения сравнительной морфологии паразитологии, физиологии, репродуктивной биологии, транскриптомики и геномики. Однако характеристика занимаемых ими экологических ниш до сих пор имеет фрагментарный характер. Анализ комплекса микроорганизмов, с которыми разные виды и экотипы литторин, населяющие контрастные биотопы, формируют стабильные биоценотические взаимодействия, является важным этапом эволюционных исследований. Наш анализ был проведен с использованием методов метабаркодинга, в частности секвенирования вариабельных регионов генов малой субъединицы рибосомы с на базе технологии Illumina. Качественно и количественно охарактеризована биотическая компонента экологических ниш нескольких видов литоральных моллюсков рода Littorina, а именно сообщества микроскопических эукариот, представляющих собой потенциальный пищевой субстрат и основу для кишечных сообществ. Выяснено влияние факторов "тип биотопа", "географический регион", "вид моллюска" на характеристики этих сообществ.
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.description.abstract
metadata.value: Mollusks of the genus Littorina are informative model for evolutionary studies due to presence of the set of recently diverged species and ecotypes. These were thoroughly investigated in terms of comparative morphology, parasitology, physiology, reproduction, transctiptomic and genomics. Although, ecological niches occupied by those species are still poorly characterized. The evaluation of diversity of microorganisms the Littorinas from contrasting biotopes contact with in wild populations represents an important milestone in understanding of their evolutionary history. Our study engaged metabarcoding approach, based on Illumina sequencing of variable 18S-fragments. We succeeded in qualitative and quantitative description of the biotic components of Littorinas’ ecological niches, namely, eukaryotic microorganisms’ communities potentially consumed by feeding. The effects of such factors as “biotope type”, “snail species” and geographic location” on compositions of those communities were characterized.
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.language.iso
metadata.value: ru
metadata.name: dc.subject
metadata.value: Littorina
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: криптические виды
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: экотипы
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: микробиом
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: экологическое видообразование
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: метабаркодинг
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: 18S
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: Littorina
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.subject
metadata.value: cryptic species
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.subject
metadata.value: ecotypes
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.subject
metadata.value: microbiome
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.subject
metadata.value: ecologic speciation
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.subject
metadata.value: metabarcoding
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.subject
metadata.value: 18S
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.title
metadata.value: Analysis of composition and variability of gut microbiota in closely related species of intertidal snails of the genus Littorina
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.title.alternative
metadata.value: Анализ состава и изменчивости кишечной микробиоты в группе близких видов литоральных моллюсков рода Littorina
metadata.lang: ru_RU
resources.filename: VKR_Gafarova_E_R.pdf
resources.url: https://dspace.spbu.ru/bitstream/11701/25884/1/VKR_Gafarova_E_R.pdf
resources.format: Adobe PDF
resources.description: Article
resources.size: 2,54 MB
resources.filename: reviewSV_Gafarova_2019.pdf
resources.url: https://dspace.spbu.ru/bitstream/11701/25884/2/reviewSV_Gafarova_2019.pdf
resources.format: Adobe PDF
resources.description: ReviewSV
resources.size: 153,13 kB