title: Genotyping of influenza virus by high resolution method of the PCR products melting curves analysis (HRM-analysis)
metadata.name: dc.contributor.advisor
metadata.value: Стукова Марина Анатольевна
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.contributor.author
metadata.value: Ландграф Галина
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.contributor.author
metadata.value: Landgraf Galina
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.contributor.editor
metadata.value: Дешева Юлия Андреевна
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.contributor.editor
metadata.value: Desheva Iuliia Аndreevnа
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.date.accessioned
metadata.value: 2017-09-29T13:43:03Z
metadata.lang: -
metadata.name: dc.date.available
metadata.value: 2017-09-29T13:43:03Z
metadata.lang: -
metadata.name: dc.date.issued
metadata.value: 2017
metadata.lang: -
metadata.name: dc.identifier.other
metadata.value: 051797
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.identifier.uri
metadata.value: http://hdl.handle.net/11701/7636
metadata.lang: -
metadata.name: dc.description.abstract
metadata.value: Высокая изменчивость вирусов гриппа вызывает необходимость ежегодного обновления штаммового состава гриппозных вакцин. На промежуточных этапах подготовки вакцинного штамма, когда нужно быстро проанализировать значительное число реассортантов (провести первичный скрининг), возникает потребность в разработке новейших быстрых и недорогих методов первичного скрининга. Данная работа посвящена разработке эффективной и экономичной методики генотипирования реассортантных вирусов гриппа- ПЦР в реальном времени с последующим анализом кривых плавления высокого разрешения (high resolution melting, HRM-анализ) при использовании интеркалирующего флуоресцентного красителя EvaGreen. Молекулярно-генетический метод HRM (high resolution melting curve analysis) основан на проведении амплификации фрагментов ДНК с последующим анализом их кривых плавления с высоким разрешением. Метод отличается высокой чувствительностью и специфичностью. В отличие от других молекулярно-генетических методов HRM-анализ позволяет выявлять мутации в интересующих фрагментах генов в процессе одной реакции, позволяет определять однонуклеотидные замещения, не имеет контаминационной опасности.
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.description.abstract
metadata.value: High variability of influenza viruses makes it necessary to update strains of influenza vaccines annually. In the intermediate stages of designing a vaccine strain, when it is necessary to quickly analyze a significant number of reassortants (to conduct primary screening), a need to develop the newest quick and reasonable methods of primary screening arises. This research focuses on developing a cost-effective method of genotyping of reassortant influenza viruses - real-time PCR followed by an analysis of the high resolution melting curves (high resolution melting, HRM analysis) with the use of an intercalating fluorescent dye EvaGreen. The molecular genetic HRM method (high resolution melting curve analysis) is based on implementation of amplification of DNA fragments with subsequent analysis of their high resolution melting curves. The presented method shows high sensitivity and specificity. Unlike other molecular genetic methods, HRM analysis makes it possible to detect all mutations in the targeted fragments of genes during one reaction and to detect single-nucleotide replacements. The method does not have any contamination hazard.
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.language.iso
metadata.value: ru
metadata.lang: -
metadata.name: dc.subject
metadata.value: вирус гриппа
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: живая гриппозная вакцина
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: HRM анализ
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: influenza virus
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.subject
metadata.value: live influenza vaccine
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.subject
metadata.value: HRM-analysis
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.title
metadata.value: Genotyping of influenza virus by high resolution method of the PCR products melting curves analysis (HRM-analysis)
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.title.alternative
metadata.value: Генотипирование вирусов гриппа методом анализа кривых плавления продуктов ПЦР высокого разрешения (HRM-анализ)
metadata.lang: ru_RU
resources.filename: VKR_Landgraf.doc
resources.url: https://dspace.spbu.ru/bitstream/11701/7636/1/VKR_Landgraf.doc
resources.format: Microsoft Word
resources.description: Article
resources.size: 1,88 MB
resources.filename: reviewSV_Otzyv_nauchnogo_rukovoditelya_Landgraf.pdf
resources.url: https://dspace.spbu.ru/bitstream/11701/7636/2/reviewSV_Otzyv_nauchnogo_rukovoditelya_Landgraf.pdf
resources.format: Adobe PDF
resources.description: ReviewSV
resources.size: 1,2 MB
resources.filename: reviewSV_st009190_Desheva_YUliya_Andreevna_(supervisor)(Ru).txt
resources.url: https://dspace.spbu.ru/bitstream/11701/7636/3/reviewSV_st009190_Desheva_YUliya_Andreevna_%28supervisor%29%28Ru%29.txt
resources.format: Text
resources.description: ReviewSV
resources.size: 4,26 kB
resources.filename: reviewSV_Kriterii_ocenki_Landgraf_GO.pdf
resources.url: https://dspace.spbu.ru/bitstream/11701/7636/8/reviewSV_Kriterii_ocenki_Landgraf_GO.pdf
resources.format: Adobe PDF
resources.description: ReviewRev
resources.size: 532,85 kB
resources.filename: reviewSV_Recenziya_Landgraf_GO.pdf
resources.url: https://dspace.spbu.ru/bitstream/11701/7636/9/reviewSV_Recenziya_Landgraf_GO.pdf
resources.format: Adobe PDF
resources.description: ReviewRev
resources.size: 1,78 MB
resources.filename: reviewSV_stt02544_Stukova_Marina_Anatolevna_(reviewer)(Ru).txt
resources.url: https://dspace.spbu.ru/bitstream/11701/7636/11/reviewSV_stt02544_Stukova_Marina_Anatolevna_%28reviewer%29%28Ru%29.txt
resources.format: Text
resources.description: ReviewRev
resources.size: 7,58 kB