title: Development of a model of organotypic tissue cultures to determine the chemosensitivity of non-small-cell lung tumors
metadata.name: dc.contributor.advisor
metadata.value: Иванцов Александр Олегович
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.contributor.advisor
metadata.value: Ivancov Aleksandr Olegovic
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.contributor.author
metadata.value: Баскина Софья Владимировна
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.contributor.author
metadata.value: Baskina Sofa Vladimirovna
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.contributor.editor
metadata.value: Спивак Ирина Михайловна
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.contributor.editor
metadata.value: Spivak Irina Mihajlovna
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.date.accessioned
metadata.value: 2021-08-07T09:11:18Z
metadata.lang: -
metadata.name: dc.date.available
metadata.value: 2021-08-07T09:11:18Z
metadata.lang: -
metadata.name: dc.date.issued
metadata.value: 2021
metadata.name: dc.identifier.other
metadata.value: 060553
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.identifier.uri
metadata.value: http://hdl.handle.net/11701/32319
metadata.lang: -
metadata.name: dc.description.abstract
metadata.value: Рак легкого занимает позицию одного из самых распространенных онкологических заболеваний. Несмотря на успехи в применении таргетной терапии цитостатические препараты остаются одним из основных видов терапии таких опухолей. Поиск адекватных моделей для оценки химиочувствительности карцином является одной из актуальных проблем персонализированного подхода в онкологии. Перспективной моделью представляются 3D-модели, сохраняющие пространственную структуру ткани и межклеточное взаимодействие – тканевые экспланты (опухолевые срезы, tumor tissue slices).
  Целью исследования стала апробация модели тканевых эксплантов для анализа химиочувствительности немелкоклеточных опухолей легкого ex vivo. Были выполнены работы по получению и инкубации тканевых эксплантов опухолей легкого с цисплатином и гефитинибом для образцов 28 пациентов. После молекулярно-генетического анализа в качестве положительных контролей чувствительности к гефитинибу были определены опухоли с активирующими мутациями гена EGFR. Выполнялась оценка сохранности ткани с помощью световой микроскопии и уровня экспрессии маркеров пролиферации Ki67 и TPX2 на уровне белка и РНК. Также было проведено транскриптомное секвенирование 7 образцов для выявления дополнительных маркеров ответа опухолей на терапию.
  По результатам морфологического анализа показано, что тканевые пластинки после инкубации сохраняли жизнеспособность и гистологическую структуру. Результаты оценки уровня экспрессии Ki67 на уровне белка и РНК продемонстрировали значительную дискордантность (R2=0,27). На уровне РНК показано, что опухоли с мутациями EGFR демонстрировали уменьшение относительной экспрессии TPX2 при инкубации с гефитинибом и цисплатином. По результатам транскриптомного секвенирования для дальнейшего анализа были выбраны гены HEXIM1, HSPA2, TOB1 и TSPYL2, экспрессия которых увеличилась при обработке эксплантов цисплатином. Было обнаружено статистически значимое увеличение экспрессии всех кандидатных генов при воздействии на пластинки цисплатина, но не гефитиниба (p-value<0,05).
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.description.abstract
metadata.value: Worldwide, lung cancer remains to be one of the most common cancers diagnosed. Despite the success with targeted therapies, cytostatic drugs are still one of the main forms of treatment for such tumors. The search for appropriate models to determine the chemosensitivity of carcinomas is a pressing issue in a personalized approach in oncology. Tissue explants (or tumor tissue slices) are a promising 3D model that preserves the spatial structure of the tissue and intercellular interaction.
  The study aimed to test the tissue explants model for the ex vivo analysis of the chemosensitivity of non-small cell lung tumors. Tissue explants were derived from lung tumors of 28 patients and incubated with cisplatin and gefitinib. After molecular-genetic analysis, tumors with activating mutations of the EGFR gene were used as positive controls for their sensitivity to gefitinib. Tissue preservation was assessed using a method of light microscopy and the expression level of proliferation markers Ki67 and TPX2 at the protein and RNA levels. Transcriptome sequencing of 7 samples was also carried out to identify additional markers of tumor response to the therapy.
  According to the results of morphological analysis, it was shown that the tissue explants retained their viability and histological structure after incubation. The results of assessing the level of Ki67 expression at the protein and RNA levels showed significant discordance (R2 = 0.27). At the RNA level, it was shown that tumors with the EGFR mutations demonstrated a reduced relative expression of TPX2 when incubated with gefitinib and cisplatin. Based on transcriptome sequencing results, HEXIM1, HSPA2, TOB1, and TSPYL2 genes were selected for further research; their expression increased upon treatment of explants with cisplatin. A statistically significant increase in the expression of all candidate genes was found when the explants were exposed to cisplatin, but not gefitinib (p-value <0.05).
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.language.iso
metadata.value: ru
metadata.name: dc.subject
metadata.value: рак легкого
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: тканевые пластинки
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: тестирование лекарственных препаратов
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: персонализированная медицина
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: lung cancer
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.subject
metadata.value: personalized medicine
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.subject
metadata.value: functional drug testing
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.subject
metadata.value: organotypic tissue slices
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.title
metadata.value: Development of a model of organotypic tissue cultures to determine the chemosensitivity of non-small-cell lung tumors
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.title.alternative
metadata.value: Разработка модели органотипических тканевых культур для определения химиочувствительности немелкоклеточных опухолей легкого
metadata.lang: ru_RU
resources.filename: VKR_itog_Baskina.pdf
resources.url: https://dspace.spbu.ru/bitstream/11701/32319/1/VKR_itog_Baskina.pdf
resources.format: Adobe PDF
resources.description: Article
resources.size: 1,76 MB
resources.filename: reviewSV_otzyv_nauc.ruk._Baskina_SV_2021.pdf
resources.url: https://dspace.spbu.ru/bitstream/11701/32319/2/reviewSV_otzyv_nauc.ruk._Baskina_SV_2021.pdf
resources.format: Adobe PDF
resources.description: ReviewSV
resources.size: 251,55 kB