title: Conformational changes of DNA upon interaction with small peptides
metadata.name: dc.contributor.advisor
metadata.value: Меркурьева Анна Александровна
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.contributor.author
metadata.value: Вашукевич Евгений Александрович
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.contributor.author
metadata.value: Vashukevich Evgenii
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.contributor.editor
metadata.value: Касьяненко Нина Анатольевна
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.contributor.editor
metadata.value: Kasianenko Nina Аnаtolevnа
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.date.accessioned
metadata.value: 2018-07-25T20:35:08Z
metadata.lang: -
metadata.name: dc.date.available
metadata.value: 2018-07-25T20:35:08Z
metadata.lang: -
metadata.name: dc.date.issued
metadata.value: 2017
metadata.lang: -
metadata.name: dc.identifier.other
metadata.value: 023825
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.identifier.uri
metadata.value: http://hdl.handle.net/11701/11716
metadata.lang: -
metadata.name: dc.description.abstract
metadata.value: Целью работы является исследование влияния коротких пептидов AEDL, EDR, KEDW на конформацию ДНК в растворе. Анализ данных показывает, что все три пептида связываются с молекулой ДНК, вызывая дестабилизацию вторичной структуры. По спектрам флуоресценции красителя DAPI в растворе комплексов ДНК - пептид   можно сделать вывод, что пептид AEDL связывается по большой бороздке.  Гидродинамическими методами установлено, что образование комплекса ДНК-пептид вызывает относительное уменьшение вязкости раствора ДНК, что свидетельствует о влиянии коротких пептидов на третичную структуру молекулы ДНК.  Данные изотермического калориметрического титрования также свидетельствуют об образовании комплексов в растворе. По совокупности результатов экспериментов можно заключить, что используемые в работе короткие пептиды взаимодействуют с молекулой ДНК в растворе. Это взаимодействие более ярко проявляется при больших концентрациях пептидов растворе ДНК (более 3 молекул пептида на одну пару оснований).  Связывание пептида  вызывает дестабилизацию вторичной структуры ДНК, а также оказывает влияние на третичную структуру макромолекулы.  Комплексы пептид-ДНК исследовались методами спектрофотометрии, флуоресценции, калориметрии, низкоградиентной вискозиметрии.
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.description.abstract
metadata.value: The aim of the work is to study the influence of short peptides AEDL, EDR, KEDW on DNA conformation in a solution. Analysis of the experimental data shows that all three peptides bind to the DNA molecule, causing destabilization of its secondary structure, It can be concluded from the fluorescence spectra of DAPI dye in a solution with DNA-peptide complexes that peptide AEDL binds along a large groove.  Hydrodynamic methods have shown that the formation of the DNA-peptide complex causes a relative decrease in the viscosity of DNA solutions, which indicates the effect of short peptides on the tertiary structure of the DNA molecule.  The data of isothermal calorimetric titration also indicate the formation of complexes in solution. On the basis of the results of the experiments, it can be concluded that the short peptides used in the work interact with the DNA molecule in a solution. This interaction is more pronounced at high concentrations of peptides in DNA solutions (more than 3 peptide molecules per DNA base pair). Binding of the peptide causes destabilization of the secondary structure of DNA, and also affects the tertiary structure of macromolecule.
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.language.iso
metadata.value: ru
metadata.lang: -
metadata.name: dc.subject
metadata.value: ДНК
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: пептид
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: УФ спектры поглощения
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: калориметрическое титрование
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: флуоресценция
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: DNA
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.subject
metadata.value: peptide
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.subject
metadata.value: UV absorption spectra
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.subject
metadata.value: calorimetric titration
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.subject
metadata.value: fluorescence
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.title
metadata.value: Conformational changes of DNA upon interaction with small peptides
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.title.alternative
metadata.value: Конформационные изменения ДНК при взаимодействии с малыми пептидами
metadata.lang: ru_RU
resources.filename: Magisterskaya_Vashukevich_E_A_.docx
resources.url: https://dspace.spbu.ru/bitstream/11701/11716/1/Magisterskaya_Vashukevich_E_A_.docx
resources.format: Microsoft Word XML
resources.description: Article
resources.size: 4,04 MB
resources.filename: reviewSV_Vashukevich.jpg
resources.url: https://dspace.spbu.ru/bitstream/11701/11716/2/reviewSV_Vashukevich.jpg
resources.format: JPEG
resources.description: ReviewRev
resources.size: 535,94 kB
resources.filename: reviewSV_Vashukevich_jpg_2.jpg
resources.url: https://dspace.spbu.ru/bitstream/11701/11716/3/reviewSV_Vashukevich_jpg_2.jpg
resources.format: JPEG
resources.description: ReviewRev
resources.size: 485,61 kB
resources.filename: reviewSV_st002425_Kasyanenko_Nina_Anatolevna_(supervisor)(Ru).txt
resources.url: https://dspace.spbu.ru/bitstream/11701/11716/6/reviewSV_st002425_Kasyanenko_Nina_Anatolevna_%28supervisor%29%28Ru%29.txt
resources.format: Text
resources.description: ReviewSV
resources.size: 3,59 kB