title: Variable identification of natural products by mass spectra
metadata.name: dc.contributor.advisor
metadata.value: Гуревич Алексей Александрович
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.contributor.advisor
metadata.value: Gurevic Aleksej Aleksandrovic
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.contributor.author
metadata.value: Вяткин Никита Сергеевич
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.contributor.author
metadata.value: Vatkin Nikita Sergeevic
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.contributor.editor
metadata.value: Степанов Алексей Владимирович
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.contributor.editor
metadata.value: Stepanov Aleksej Vladimirovic
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.date.accessioned
metadata.value: 2023-07-26T12:02:57Z
metadata.lang: -
metadata.name: dc.date.available
metadata.value: 2023-07-26T12:02:57Z
metadata.lang: -
metadata.name: dc.date.issued
metadata.value: 2023
metadata.name: dc.identifier.other
metadata.value: 076390
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.identifier.uri
metadata.value: http://hdl.handle.net/11701/42116
metadata.lang: -
metadata.name: dc.description.abstract
metadata.value: В данной работе разработан метод вариативной идентификации пептидных природных соединений по масс-спектрам с учётом двух возможных модификаций. При этом одна модификация предполагается фиксированной, а вторая -- произвольная. Фиксированная модификация может быть как одной из высокочастотных, так и некоторой специальной, заданной пользователем в соответствии с его интересами. Метод был протестирован на данных из баз GNPS и PNPdatabase.
  
  Реализованный метод позволяет идентифицировать масс-спектры ранее неизвестных пептидных природных соединений, которые не могли быть идентифицированы современными алгоритмами, что, в свою очередь, ускоряет поиск новых антибиотиков, иммунодепрессантов и других лекарств.
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.description.abstract
metadata.value: In this work, I have developed a method for the variative identification of peptidic natural products by mass spectra, taking into account two possible modifications. In this case, one modification is assumed to be fixed, and the second is arbitrary. A fixed modification can be either one of the high-frequency ones, or some special one, set by the user in accordance with his interests. The method was tested on data from the GNPS and PNPdatabases.
  
  The implemented method makes it possible to identify the mass spectra of previously unknown peptidic natural products that could not be identified by modern algorithms, which, in turn, speeds up the search for new antibiotics, immunosuppressants and other drugs.
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.language.iso
metadata.value: ru
metadata.name: dc.subject
metadata.value: вычислительная масс-спектрометрия
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: биоинформатика
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: изоморфизм графов
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: computational mass spectrometry
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.subject
metadata.value: bioinformatics
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.subject
metadata.value: graph isomorphism
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.title
metadata.value: Variable identification of natural products by mass spectra
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.title.alternative
metadata.value: Вариативная идентификация природных соединений по масс-спектрам
metadata.lang: ru_RU
resources.filename: st076390.pdf
resources.url: https://dspace.spbu.ru/bitstream/11701/42116/2/st076390.pdf
resources.format: Adobe PDF
resources.description: Article
resources.size: 279,02 kB
resources.filename: reviewSV_Vyatkin.docx
resources.url: https://dspace.spbu.ru/bitstream/11701/42116/3/reviewSV_Vyatkin.docx
resources.format: Microsoft Word XML
resources.description: ReviewSV
resources.size: 25,25 kB