title: Investigation of photoactivation mechanisms of archaerhodopsin-3 voltage-sensitive fluorescent derivatives
metadata.name: dc.contributor.advisor
metadata.value: Вязьмин Сергей Юрьевич
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.contributor.advisor
metadata.value: Vazmin Sergej Urevic
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.contributor.author
metadata.value: Миронов Владимир Николаевич
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.contributor.author
metadata.value: Mironov Vladimir Nikolaevic
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.contributor.editor
metadata.value: Рязанцев Михаил Николаевич
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.contributor.editor
metadata.value: Razancev Mihail Nikolaevic
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.date.accessioned
metadata.value: 2021-08-07T09:12:00Z
metadata.lang: -
metadata.name: dc.date.available
metadata.value: 2021-08-07T09:12:00Z
metadata.lang: -
metadata.name: dc.date.issued
metadata.value: 2021
metadata.name: dc.identifier.other
metadata.value: 079521
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.identifier.uri
metadata.value: http://hdl.handle.net/11701/32563
metadata.lang: -
metadata.name: dc.description.abstract
metadata.value: Выпускная квалификационная работа посвящена определению механизма, отвечающего за потенциал-зависимость флуоресценции бактериального родопсина археородопсина-3 и его производных. Актуальность работы заключается в том, что археородопсин-3 и его производные, полученные путем внесения в белок аминокислотных замен, широко используются в оптогенетических исследованиях для визуализации активности нейронов, что возможно благодаря уникальным характеристикам флуоресценции данных белков, интенсивность которой зависит от величины мембранного потенциала клетки. Определение механизма, ответственного за потенциал-зависимость флуоресценции археородопсина-3 и его производных позволяет проводить рациональное конструирование новых производных археородопсина-3 с оптимальными для оптогенетических применений свойствами. В работе, которая была проведена с использованием как экспериментальных спектроскопических методов, биотехнологических методов и методов компьютерного моделирования, были получены следующие результаты – было определено состояния белка, фотоактивация которого приводит к возникновению флуоресцентного сигнала, были определены механизмы стабилизации данного состояния; был определен механизм, определяющий потенциал-зависимость флуоресценции белка.
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.description.abstract
metadata.value: The master thesis is devoted to the investigation of the mechanism that governs the potential dependence of fluorescence in microbial rhodopsin archaerhodopsin-3 and its derivatives. This topic is relevant because archaerhodopsin-3 and its derivatives are widely used in optogenetic studies for the visualization of neural activity, which is possible due to the unique properties of fluorescence these proteins possess, the intensity of fluorescence intensity depends on the value of cell membrane potential. Determining the mechanism that governs the potential dependence of the fluorescence in archaerhodopsin-3 and its derivatives allows for performing the rational design of new archaerhodopsin-3 derivatives with the optimal optical properties for optogenetic applications. In the current study experimental spectroscopic methods, biotechnology methods, and computational modeling methods were used. In the current study the following results were obtained – the state of the protein, which leads to fluorescence upon photoactivation, was determined, the mechanisms that stabilize this state were determined; the mechanism which governs potential-dependence of archaerhodopsin-3 fluorescence was determined
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.language.iso
metadata.value: ru
metadata.name: dc.subject
metadata.value: Археородопсин-3
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: бактериальные родопсины
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: флуоресценция
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: мембранный потенциал клетки
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: спектроскопия комбинационного рассеяния
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: оптические методы исследования в нанобиотехнологиях
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: молекулярная биоинженерия
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: компьютерное моделирование биологических молекул
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: Archaerhodopsin-3
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.subject
metadata.value: microbial rhodopsins
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.subject
metadata.value: fluorescence
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.subject
metadata.value: cell membrane potential
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.subject
metadata.value: Raman spectroscopy
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.subject
metadata.value: optical methods in nanobiotechnology
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.subject
metadata.value: molecular bioengineering
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.subject
metadata.value: computational modeling of biological molecules
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.title
metadata.value: Investigation of photoactivation mechanisms of archaerhodopsin-3 voltage-sensitive fluorescent derivatives
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.title.alternative
metadata.value: Изучение механизмов фотоактивации потенциал-зависимых флуоресцентных белков на основе археородопсина-3
metadata.lang: ru_RU
resources.filename: magisterskaa_VKR_Mironov_VN.pdf
resources.url: https://dspace.spbu.ru/bitstream/11701/32563/1/magisterskaa_VKR_Mironov_VN.pdf
resources.format: Adobe PDF
resources.description: Article
resources.size: 4,33 MB
resources.filename: reviewSV_Otzyv_Mironov.pdf
resources.url: https://dspace.spbu.ru/bitstream/11701/32563/2/reviewSV_Otzyv_Mironov.pdf
resources.format: Adobe PDF
resources.description: ReviewSV
resources.size: 429,97 kB