title: The study of the pathogenesis of arthrogryposis by methods of proteomics and genetics
metadata.name: dc.contributor.advisor
metadata.value: Дубровский Ярослав Александрович
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.contributor.advisor
metadata.value: Dubrovskij Aroslav Aleksandrovic
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.contributor.author
metadata.value: Вашурина Наталья Сергеевна
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.contributor.author
metadata.value: Vasurina Natala Sergeevna
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.contributor.editor
metadata.value: Соболева Алена Вадимовна
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.contributor.editor
metadata.value: Soboleva Alena Vadimovna
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.date.accessioned
metadata.value: 2021-03-24T15:08:24Z
metadata.lang: -
metadata.name: dc.date.available
metadata.value: 2021-03-24T15:08:24Z
metadata.lang: -
metadata.name: dc.date.issued
metadata.value: 2019
metadata.name: dc.identifier.other
metadata.value: 047322
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.identifier.uri
metadata.value: http://hdl.handle.net/11701/25873
metadata.lang: -
metadata.name: dc.description.abstract
metadata.value: На сегодняшний день артрогрипоз является одним из самых тяжелых врожденных пороков развития опорно-двигательного аппарата. Для этого заболевания характерны множественные контрактуры суставов конечностей, и, как следствие, их деформация. Как правило, дети с таким диагнозом являются тяжелыми инвалидами. Этиология данного заболевания остается неясной. В данном исследовании мы задавались целью изучить молекулярные механизмы развития артрогрипоза с помощью методов протеомики и геномики. С помощью экзомного секвенирования и секвенирования по Сэнгеру были проанализированы 35 образцов ДНК пациентов, больных артрогрипозом, и 2 здоровых родственника, в результате чего у 5 пациентов выявлены ранее описанные как патогенные, ассоциированные с артрогрипозом мутации в гене TNNT3, у двух – в гене TRPV4. У одного пациента впервые была обнаружена неаннотированная в базах данных замена в гене TPM2. Наличие мутаций у здоровых родственников опровергнуто. Белковые фракции, выделенные из мышечной ткани пациентов, больных артрогрипозом, и индивидуумов без артрогрипоза (контролей)  были охарактеризованы с помощью одномерного и двумерного электрофореза, а также дифференциального двумерного электрофореза. С помощью хромато-масс-спектрометрического анализа идентифицированы 8 белковых фракций из мышечной ткани пациента, больного артрогрипозом, и 11 белковых фракций из мышечной ткани индивидуума без артрогрипоза. Было выявлено отсутствие белков кофилина-2, карбоангидразы-3, аденилаткиназы-1 и тропонина I скелетной мускулатуры в пробе пациента, больного артрогрипозом.
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.description.abstract
metadata.value: Today arthrogryposis is one of the most severe congenital malformations of the musculoskeletal system. This disease is characterized by multiple contractures of the joints of the limbs, and, as a result, their deformity. As a rule, children with such a diagnosis are severely disabled. The etiology of this disease remains unclear. In this study, we set the goal of studying the molecular mechanisms of arthrogryposis development using the methods of proteomics and genomics. Using  exome sequencing and Sanger's sequencing, 35 DNA samples of patients with arthrogryposis and 2 healthy relatives were analyzed, resulting in 5 patients mutations identified as pathogenic, associated with arthrogryposis in the TNNT3 gene were found, in two patients mutation in the TRPV4 gene was found. In one patient unannotated in databases replacement in the TPM2 gene was first discovered. The presence of mutations in healthy relatives is refuted. Protein fractions isolated from the muscle tissue of patients with arthrogryposis and individuals without arthrogryposis (controls) were characterized using one-dimensional and two-dimensional electrophoresis, as well as 2D DIGE. Using chromatography-mass spectrometric analysis, 8 protein fractions from the muscle tissue of a patient suffering from arthrogryposis and 11 protein fractions from the muscle tissue of an individual without arthrogryposis were identified. The absence of proteins cofilin-2, carbonic anhydrase-3, adenylate kinase-1 and troponin I of skeletal muscles in the sample of a patient with arthrogryposis was revealed.
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.language.iso
metadata.value: ru
metadata.name: dc.subject
metadata.value: Артрогрипоз
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: контрактуры
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: протеомика
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: геномика
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: Arthrogryposis
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.subject
metadata.value: contractures
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.subject
metadata.value: proteomics
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.subject
metadata.value: genomics
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.title
metadata.value: The study of the pathogenesis of arthrogryposis by methods of proteomics and genetics
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.title.alternative
metadata.value: Изучение патогенеза артрогрипоза методами протеомики и генетики
metadata.lang: ru_RU
resources.filename: VKR_Vasurina.pdf
resources.url: https://dspace.spbu.ru/bitstream/11701/25873/1/VKR_Vasurina.pdf
resources.format: Adobe PDF
resources.description: Article
resources.size: 1,92 MB
resources.filename: reviewSV_Review_of_project_accomplishment__Vashurina_2019_.pdf
resources.url: https://dspace.spbu.ru/bitstream/11701/25873/2/reviewSV_Review_of_project_accomplishment__Vashurina_2019_.pdf
resources.format: Adobe PDF
resources.description: ReviewSV
resources.size: 283,84 kB
resources.filename: reviewSV_Otzyv_naucnogo_rukovoditela__Vasurina_N.S.__2019.pdf
resources.url: https://dspace.spbu.ru/bitstream/11701/25873/3/reviewSV_Otzyv_naucnogo_rukovoditela__Vasurina_N.S.__2019.pdf
resources.format: Adobe PDF
resources.description: ReviewSV
resources.size: 368,84 kB