title: Parallelizing Forward и Backward-Forward filters on GPGPU in a problem of searching genes homologs by hidden Markov models
metadata.name: dc.contributor.advisor
metadata.value: Бычков Александр Борисович
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.contributor.author
metadata.value: Тарасенко Никита Дмитриевич
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.contributor.author
metadata.value: Tarasenko Nikita
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.contributor.editor
metadata.value: Сартасов Станислав Юрьевич
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.contributor.editor
metadata.value: Sartasov Stanislav Iurevich
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.date.accessioned
metadata.value: 2018-07-26T15:26:05Z
metadata.lang: -
metadata.name: dc.date.available
metadata.value: 2018-07-26T15:26:05Z
metadata.lang: -
metadata.name: dc.date.issued
metadata.value: 2018
metadata.name: dc.identifier.other
metadata.value: 033590
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.identifier.uri
metadata.value: http://hdl.handle.net/11701/13469
metadata.lang: -
metadata.name: dc.description.abstract
metadata.value: Анотация к ВКР Н.Д. Тарасенко "Распараллеливание на GPGPU фильтров Forward и Backward-Forward в задаче поиска гомологов генов скрытыми марковскими моделями".  Данная выпускная квалификационная работа посвящена реализации эффективной версии алгоритмов Forward и Backward-Forward с применением технологии NVIDIA CUDA. В рамках работы сделан обзор предметной области и существующих решений, разработана модель оптимизации существующей реализации алгоритмов в инструменте HMMer, создан прототипы более эффективных версий Forward и Backward-Forward.
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.description.abstract
metadata.value: This diploma thesis is devoted to the implementation of an effective version of Forward and Backward-Forward algorithms using NVIDIA CUDA technology. This work the review of the subject area and existing solutions was made, a model for optimizing the existing implementation of algorithms in the HMMer tool was developed, prototypes of more efficient versions of Forward and Backward-Forward were created.
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.language.iso
metadata.value: ru
metadata.name: dc.subject
metadata.value: Скрытые Марковские модели
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: CUDA
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: HMMer
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: Forward
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: Backward
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: Backward-Forward
metadata.lang: ru_RU
metadata.name: dc.subject
metadata.value: Hidden Markov models
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.subject
metadata.value: CUDA
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.subject
metadata.value: HMMer
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.subject
metadata.value: Forward
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.subject
metadata.value: Backward
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.subject
metadata.value: Backward-Forward
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.title
metadata.value: Parallelizing Forward и Backward-Forward filters on GPGPU in a problem of searching genes homologs by hidden Markov models
metadata.lang: en_GB
metadata.name: dc.title.alternative
metadata.value: Распараллеливание на GPGPU фильтров Forward и Backward-Forward в задаче поиска гомологов генов скрытыми марковскими моделями
metadata.lang: ru_RU
resources.filename: Tarasenko_DiplomaThesis_(1).pdf
resources.url: https://dspace.spbu.ru/bitstream/11701/13469/1/Tarasenko_DiplomaThesis_%281%29.pdf
resources.format: Adobe PDF
resources.description: Article
resources.size: 1,64 MB
resources.filename: reviewSV_Tarasenko_-_otzyv.docx
resources.url: https://dspace.spbu.ru/bitstream/11701/13469/2/reviewSV_Tarasenko_-_otzyv.docx
resources.format: Microsoft Word XML
resources.description: ReviewSV
resources.size: 26,87 kB
resources.filename: reviewSV_Recenziya_na_vypusknuyu_kvalifikacionnuyu_rabotu_2.pdf
resources.url: https://dspace.spbu.ru/bitstream/11701/13469/3/reviewSV_Recenziya_na_vypusknuyu_kvalifikacionnuyu_rabotu_2.pdf
resources.format: Adobe PDF
resources.description: ReviewRev
resources.size: 138,39 kB
resources.filename: reviewSV_st900710_Sartasov_Stanislav_YUrevich_(supervisor)(Ru).txt
resources.url: https://dspace.spbu.ru/bitstream/11701/13469/4/reviewSV_st900710_Sartasov_Stanislav_YUrevich_%28supervisor%29%28Ru%29.txt
resources.format: Text
resources.description: ReviewSV
resources.size: 7,33 kB